Ekde la komenco de la pandemio, diagnozaj provoj ludis esencan rolon por kontroli la disvastiĝon de SARS-CoV-2, la viruso kiu kaŭzasCOVID-19.Rapidaj antigenaj provojfarita hejme aŭ en klinika medio donas rezultojn en 15 minutoj aŭ malpli.Ju pli frue homo estas diagnozita, des pli frue li povas serĉi medicinan atenton kaj izoli sin de aliaj.Sed kiam novaj variaĵoj de la viruso aperas, tiuj variaĵoj eble ne estas detektitaj per ĉi tiuj provoj.
Plej rapidaj antigenaj testoj estas dizajnitaj por detekti la SARS-CoV-2-nukleokapsidproteinon aŭ N-proteinon.Ĉi tiu proteino troviĝas en abundo en virusaj partikloj kaj infektitaj homoj.Rapida testa ilaros kutime enhavas du malsamajn diagnozajn antikorpojn kiuj ligas al malsamaj partoj de la N-proteino.Kiam antikorpo ligas al la N-proteino en provaĵo, kolora linio aŭ alia signalo aperas sur la testkompleto, indikante infekton.
Proteino N konsistas el 419 strukturaj unuoj de aminoacidoj.Iu ajn el ili povas esti anstataŭigita per alia aminoacido per mutacio.Esplorgrupo gvidita de Ph.D.Philip Frank kaj Eric Ortlund de Emory University komencis esplori kiel ĉi tiu ununura aminoacida ŝanĝo influas la agadon de rapida antigentesto.Ili uzis teknikon nomitan profunda mutacia skanado por samtempe taksi kiel ĉiu mutacio en la N-proteino de la viruso influas ligadon al diagnoza antikorpo.Iliaj rezultoj estis publikigitaj en Cell la 15-an de septembro 2022.
La esploristoj kreis ampleksan bibliotekon de preskaŭ 8,000 N proteinmutacioj.Tiuj variaĵoj respondecas pri pli ol 99.5% de ĉiuj eblaj mutacioj.Ili tiam taksis kiel ĉiu varianto interagis kun 17 malsamaj diagnozaj antikorpoj uzitaj en 11 komerce haveblaj rapidaj antigentestoj, inkluzive de oftaj.hejmaj iloj.
La teamo taksis kiuj N-proteinaj mutacioj influas antikorprekonon.Surbaze de ĉi tiuj informoj, ili kreis "fuĝan mutacian profilon" por ĉiu diagnoza antikorpo.Tiu profilo identigas specifajn mutaciojn en la N-proteino kiu povas influi la kapablon de la antikorpo ligi al sia celo.La analizo montris, ke la antikorpoj uzataj en la hodiaŭaj rapidaj testoj rekonas kaj ligas ĉiujn pasintajn kaj nunajn variantojn de SARS-CoV-2 zorgaj kaj zorgaj.
Kvankam pluraj diagnozaj antikorpoj rekonas la saman regionon de la N-proteino, la esploristoj trovis, ke ĉiu antikorpo havas unikan subskribon de eskapaj mutacioj.Ĉar la SARS-CoV-2-viruso daŭre mutacias kaj generas novajn variaĵojn, ĉi tiuj datumoj povas esti uzataj por marki testajn ilajn antikorpojn, kiuj eble devas esti retaksitaj.
"Preciza kaj efika identigo de infektitaj individuoj restas kritika strategio por mildigo de COVID-19, kaj nia studo provizas informojn pri estontaj mutacioj de SARS-CoV-2, kiuj povus malhelpi detekton," diris Ortlund."La rezultoj skizitaj ĉi tie permesas al ni rapide adaptiĝi al ĉi tiu viruso dum novaj variantoj daŭre aperas, prezentante tujajn klinikajn kaj publikajn sanajn implicojn."
Fono: Mutation Deep Scan detektas eskapan mutaciojn en la SARS-CoV-2-nukleokapsido uzante nuntempe disponeblajn rapidajn antigenajn testojn.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA-ĉelo.2022 la 15-an de septembro;185(19):3603-3616.e13.Ministerio pri Interno: 10.1016/j.cell.2022.08.010.la 29-an de aŭgusto 2022 PMID: 36084631.
Financado: Nacia Instituto por Biomedicina Bildigo kaj Bioinĝenierado NIH (NIBIB), Nacia Instituto pri Diabeto, Digesta kaj Renaj Malsanoj (NIDDK) kaj Nacia Instituto pri Alergio kaj Infektaj Malsanoj (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters estas semajna ĝisdatigo de ŝlosilaj NIH-esploraj trovoj reviziitaj de NIH-fakuloj.Ĝi estas publikigita de la Oficejo pri Komunikado kaj Publikaj Aferoj de la Direktoro de la Naciaj Institutoj pri Sano.